Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rufy3Q9D394 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rufy3Q9D394 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rufy3Q9D394 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rufy3Q9D394 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rufy3Q9D394 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rufy3Q9D394 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rufy3Q9D394 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rufy3Q9D394 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rufy3Q9D394 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rufy3Q9D394 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rufy3Q9D394 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rufy3Q9D394 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rufy3Q9D394 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rufy3Q9D394 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Rufy3Q9D394 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rufy3Q9D394 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Rufy3Q9D394 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Rufy3Q9D394 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rufy3Q9D394 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rufy3Q9D394 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rufy3Q9D394 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rufy3Q9D394 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rufy3Q9D394 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rufy3Q9D394 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rufy3Q9D394 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rufy3Q9D394 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rufy3Q9D394 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rufy3Q9D394 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rufy3Q9D394 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rufy3Q9D394 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rufy3Q9D394 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rufy3Q9D394 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rufy3Q9D394 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rufy3Q9D394 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rufy3Q9D394 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rufy3Q9D394 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rufy3Q9D394 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rufy3Q9D394 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rufy3Q9D394 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rufy3Q9D394 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Rufy3Q9D394 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rufy3Q9D394 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rufy3Q9D394 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rufy3Q9D394 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rufy3Q9D394 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rufy3Q9D394 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rufy3Q9D394 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rufy3Q9D394 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rufy3Q9D394 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rufy3Q9D394 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rufy3Q9D394 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rufy3Q9D394 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rufy3Q9D394 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rufy3Q9D394 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rufy3Q9D394 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rufy3Q9D394 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Rufy3Q9D394 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rufy3Q9D394 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rufy3Q9D394 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rufy3Q9D394 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rufy3Q9D394 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rufy3Q9D394 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rufy3Q9D394 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rufy3Q9D394 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rufy3Q9D394 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rufy3Q9D394 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rufy3Q9D394 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rufy3Q9D394 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rufy3Q9D394 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rufy3Q9D394 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rufy3Q9D394 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rufy3Q9D394 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rufy3Q9D394 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rufy3Q9D394 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rufy3Q9D394 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rufy3Q9D394 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rufy3Q9D394 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rufy3Q9D394 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rufy3Q9D394 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Rufy3Q9D394 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rufy3Q9D394 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rufy3Q9D394 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rufy3Q9D394 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rufy3Q9D394 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rufy3Q9D394 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rufy3Q9D394 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rufy3Q9D394 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rufy3Q9D394 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rufy3Q9D394 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rufy3Q9D394 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rufy3Q9D394 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rufy3Q9D394 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rufy3Q9D394 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rufy3Q9D394 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rufy3Q9D394 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rufy3Q9D394 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rufy3Q9D394 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rufy3Q9D394 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Rufy3Q9D394 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms