Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snrnp35Q9D384 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snrnp35Q9D384 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snrnp35Q9D384 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snrnp35Q9D384 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snrnp35Q9D384 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snrnp35Q9D384 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snrnp35Q9D384 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snrnp35Q9D384 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snrnp35Q9D384 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snrnp35Q9D384 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snrnp35Q9D384 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snrnp35Q9D384 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Snrnp35Q9D384 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snrnp35Q9D384 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snrnp35Q9D384 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snrnp35Q9D384 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snrnp35Q9D384 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snrnp35Q9D384 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snrnp35Q9D384 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snrnp35Q9D384 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snrnp35Q9D384 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Snrnp35Q9D384 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Snrnp35Q9D384 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Snrnp35Q9D384 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snrnp35Q9D384 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Snrnp35Q9D384 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snrnp35Q9D384 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snrnp35Q9D384 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snrnp35Q9D384 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snrnp35Q9D384 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snrnp35Q9D384 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snrnp35Q9D384 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snrnp35Q9D384 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snrnp35Q9D384 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snrnp35Q9D384 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snrnp35Q9D384 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snrnp35Q9D384 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snrnp35Q9D384 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snrnp35Q9D384 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snrnp35Q9D384 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snrnp35Q9D384 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snrnp35Q9D384 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snrnp35Q9D384 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snrnp35Q9D384 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snrnp35Q9D384 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snrnp35Q9D384 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snrnp35Q9D384 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snrnp35Q9D384 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snrnp35Q9D384 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snrnp35Q9D384 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snrnp35Q9D384 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snrnp35Q9D384 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Snrnp35Q9D384 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snrnp35Q9D384 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snrnp35Q9D384 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snrnp35Q9D384 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snrnp35Q9D384 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Snrnp35Q9D384 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snrnp35Q9D384 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snrnp35Q9D384 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snrnp35Q9D384 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Snrnp35Q9D384 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snrnp35Q9D384 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snrnp35Q9D384 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snrnp35Q9D384 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snrnp35Q9D384 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Snrnp35Q9D384 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snrnp35Q9D384 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snrnp35Q9D384 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snrnp35Q9D384 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snrnp35Q9D384 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snrnp35Q9D384 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snrnp35Q9D384 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Snrnp35Q9D384 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snrnp35Q9D384 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snrnp35Q9D384 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snrnp35Q9D384 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snrnp35Q9D384 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snrnp35Q9D384 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snrnp35Q9D384 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snrnp35Q9D384 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Snrnp35Q9D384 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Snrnp35Q9D384 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snrnp35Q9D384 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snrnp35Q9D384 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snrnp35Q9D384 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snrnp35Q9D384 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snrnp35Q9D384 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snrnp35Q9D384 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snrnp35Q9D384 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snrnp35Q9D384 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snrnp35Q9D384 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snrnp35Q9D384 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snrnp35Q9D384 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snrnp35Q9D384 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snrnp35Q9D384 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snrnp35Q9D384 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snrnp35Q9D384 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snrnp35Q9D384 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms