Protein–RNA interactions for Protein: Q9D304

Rnf128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf128Q9D304 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf128Q9D304 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf128Q9D304 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf128Q9D304 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf128Q9D304 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf128Q9D304 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf128Q9D304 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf128Q9D304 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf128Q9D304 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf128Q9D304 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf128Q9D304 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf128Q9D304 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf128Q9D304 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf128Q9D304 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf128Q9D304 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf128Q9D304 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rnf128Q9D304 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf128Q9D304 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf128Q9D304 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf128Q9D304 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf128Q9D304 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf128Q9D304 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms