Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
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Tmed11Q9D2R4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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Tmed11Q9D2R4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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Tmed11Q9D2R4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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