Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9D2Q3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9D2Q3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9D2Q3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9D2Q3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9D2Q3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9D2Q3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9D2Q3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9D2Q3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9D2Q3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9D2Q3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9D2Q3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9D2Q3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9D2Q3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9D2Q3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9D2Q3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9D2Q3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9D2Q3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9D2Q3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9D2Q3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9D2Q3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9D2Q3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9D2Q3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9D2Q3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9D2Q3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9D2Q3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9D2Q3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9D2Q3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9D2Q3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9D2Q3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9D2Q3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9D2Q3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9D2Q3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9D2Q3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9D2Q3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9D2Q3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9D2Q3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9D2Q3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9D2Q3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms