Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2J4

Vsig1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig1Q9D2J4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vsig1Q9D2J4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vsig1Q9D2J4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vsig1Q9D2J4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vsig1Q9D2J4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vsig1Q9D2J4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vsig1Q9D2J4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vsig1Q9D2J4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vsig1Q9D2J4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vsig1Q9D2J4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vsig1Q9D2J4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vsig1Q9D2J4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vsig1Q9D2J4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vsig1Q9D2J4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vsig1Q9D2J4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vsig1Q9D2J4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vsig1Q9D2J4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vsig1Q9D2J4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vsig1Q9D2J4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vsig1Q9D2J4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Vsig1Q9D2J4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vsig1Q9D2J4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Vsig1Q9D2J4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vsig1Q9D2J4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vsig1Q9D2J4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vsig1Q9D2J4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vsig1Q9D2J4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vsig1Q9D2J4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vsig1Q9D2J4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Vsig1Q9D2J4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vsig1Q9D2J4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vsig1Q9D2J4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vsig1Q9D2J4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vsig1Q9D2J4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vsig1Q9D2J4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vsig1Q9D2J4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vsig1Q9D2J4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vsig1Q9D2J4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vsig1Q9D2J4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vsig1Q9D2J4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vsig1Q9D2J4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vsig1Q9D2J4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vsig1Q9D2J4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vsig1Q9D2J4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vsig1Q9D2J4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vsig1Q9D2J4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vsig1Q9D2J4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vsig1Q9D2J4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vsig1Q9D2J4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vsig1Q9D2J4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vsig1Q9D2J4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vsig1Q9D2J4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Vsig1Q9D2J4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vsig1Q9D2J4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vsig1Q9D2J4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vsig1Q9D2J4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Vsig1Q9D2J4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vsig1Q9D2J4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vsig1Q9D2J4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vsig1Q9D2J4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vsig1Q9D2J4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vsig1Q9D2J4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vsig1Q9D2J4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vsig1Q9D2J4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vsig1Q9D2J4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vsig1Q9D2J4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vsig1Q9D2J4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vsig1Q9D2J4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vsig1Q9D2J4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vsig1Q9D2J4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Vsig1Q9D2J4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vsig1Q9D2J4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vsig1Q9D2J4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vsig1Q9D2J4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vsig1Q9D2J4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vsig1Q9D2J4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vsig1Q9D2J4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vsig1Q9D2J4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vsig1Q9D2J4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vsig1Q9D2J4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vsig1Q9D2J4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vsig1Q9D2J4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vsig1Q9D2J4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vsig1Q9D2J4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vsig1Q9D2J4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vsig1Q9D2J4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vsig1Q9D2J4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Vsig1Q9D2J4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vsig1Q9D2J4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vsig1Q9D2J4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vsig1Q9D2J4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vsig1Q9D2J4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vsig1Q9D2J4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Vsig1Q9D2J4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vsig1Q9D2J4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vsig1Q9D2J4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vsig1Q9D2J4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vsig1Q9D2J4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vsig1Q9D2J4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vsig1Q9D2J4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms