Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snapc3Q9D2C9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snapc3Q9D2C9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snapc3Q9D2C9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snapc3Q9D2C9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snapc3Q9D2C9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snapc3Q9D2C9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snapc3Q9D2C9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snapc3Q9D2C9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snapc3Q9D2C9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snapc3Q9D2C9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snapc3Q9D2C9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snapc3Q9D2C9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snapc3Q9D2C9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snapc3Q9D2C9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snapc3Q9D2C9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 401.5 ms