Protein–RNA interactions for Protein: Q9D226

Krtap5-3, Keratin-associated protein 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap5-3Q9D226 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krtap5-3Q9D226 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krtap5-3Q9D226 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krtap5-3Q9D226 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krtap5-3Q9D226 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krtap5-3Q9D226 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krtap5-3Q9D226 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krtap5-3Q9D226 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krtap5-3Q9D226 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krtap5-3Q9D226 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krtap5-3Q9D226 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krtap5-3Q9D226 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krtap5-3Q9D226 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krtap5-3Q9D226 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krtap5-3Q9D226 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krtap5-3Q9D226 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Krtap5-3Q9D226 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Krtap5-3Q9D226 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Krtap5-3Q9D226 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krtap5-3Q9D226 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krtap5-3Q9D226 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krtap5-3Q9D226 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krtap5-3Q9D226 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krtap5-3Q9D226 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krtap5-3Q9D226 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krtap5-3Q9D226 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krtap5-3Q9D226 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krtap5-3Q9D226 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krtap5-3Q9D226 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krtap5-3Q9D226 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Krtap5-3Q9D226 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Krtap5-3Q9D226 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krtap5-3Q9D226 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krtap5-3Q9D226 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krtap5-3Q9D226 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krtap5-3Q9D226 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krtap5-3Q9D226 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krtap5-3Q9D226 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krtap5-3Q9D226 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krtap5-3Q9D226 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krtap5-3Q9D226 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krtap5-3Q9D226 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krtap5-3Q9D226 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krtap5-3Q9D226 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krtap5-3Q9D226 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krtap5-3Q9D226 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krtap5-3Q9D226 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krtap5-3Q9D226 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krtap5-3Q9D226 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krtap5-3Q9D226 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krtap5-3Q9D226 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krtap5-3Q9D226 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krtap5-3Q9D226 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krtap5-3Q9D226 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krtap5-3Q9D226 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krtap5-3Q9D226 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krtap5-3Q9D226 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Krtap5-3Q9D226 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krtap5-3Q9D226 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krtap5-3Q9D226 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krtap5-3Q9D226 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krtap5-3Q9D226 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krtap5-3Q9D226 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krtap5-3Q9D226 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krtap5-3Q9D226 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Krtap5-3Q9D226 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krtap5-3Q9D226 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Krtap5-3Q9D226 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Krtap5-3Q9D226 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krtap5-3Q9D226 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krtap5-3Q9D226 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krtap5-3Q9D226 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Krtap5-3Q9D226 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krtap5-3Q9D226 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krtap5-3Q9D226 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krtap5-3Q9D226 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krtap5-3Q9D226 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krtap5-3Q9D226 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krtap5-3Q9D226 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krtap5-3Q9D226 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krtap5-3Q9D226 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krtap5-3Q9D226 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krtap5-3Q9D226 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krtap5-3Q9D226 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krtap5-3Q9D226 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krtap5-3Q9D226 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krtap5-3Q9D226 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krtap5-3Q9D226 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krtap5-3Q9D226 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krtap5-3Q9D226 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krtap5-3Q9D226 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krtap5-3Q9D226 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krtap5-3Q9D226 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krtap5-3Q9D226 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krtap5-3Q9D226 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krtap5-3Q9D226 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krtap5-3Q9D226 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krtap5-3Q9D226 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krtap5-3Q9D226 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krtap5-3Q9D226 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms