Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Q4

Dpm3, Dolichol-phosphate mannosyltransferase subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpm3Q9D1Q4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dpm3Q9D1Q4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dpm3Q9D1Q4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Dpm3Q9D1Q4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dpm3Q9D1Q4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dpm3Q9D1Q4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dpm3Q9D1Q4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dpm3Q9D1Q4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dpm3Q9D1Q4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dpm3Q9D1Q4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dpm3Q9D1Q4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dpm3Q9D1Q4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dpm3Q9D1Q4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dpm3Q9D1Q4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dpm3Q9D1Q4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dpm3Q9D1Q4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dpm3Q9D1Q4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Dpm3Q9D1Q4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dpm3Q9D1Q4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dpm3Q9D1Q4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dpm3Q9D1Q4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Dpm3Q9D1Q4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dpm3Q9D1Q4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dpm3Q9D1Q4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dpm3Q9D1Q4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dpm3Q9D1Q4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dpm3Q9D1Q4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dpm3Q9D1Q4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dpm3Q9D1Q4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dpm3Q9D1Q4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dpm3Q9D1Q4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dpm3Q9D1Q4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dpm3Q9D1Q4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dpm3Q9D1Q4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dpm3Q9D1Q4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dpm3Q9D1Q4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dpm3Q9D1Q4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dpm3Q9D1Q4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dpm3Q9D1Q4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dpm3Q9D1Q4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dpm3Q9D1Q4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dpm3Q9D1Q4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dpm3Q9D1Q4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dpm3Q9D1Q4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dpm3Q9D1Q4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dpm3Q9D1Q4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dpm3Q9D1Q4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dpm3Q9D1Q4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dpm3Q9D1Q4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dpm3Q9D1Q4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dpm3Q9D1Q4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dpm3Q9D1Q4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dpm3Q9D1Q4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dpm3Q9D1Q4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dpm3Q9D1Q4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dpm3Q9D1Q4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dpm3Q9D1Q4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dpm3Q9D1Q4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms