Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms