Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E4

Cysrt1, Cysteine-rich tail protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cysrt1Q9D1E4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cysrt1Q9D1E4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cysrt1Q9D1E4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cysrt1Q9D1E4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cysrt1Q9D1E4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cysrt1Q9D1E4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cysrt1Q9D1E4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cysrt1Q9D1E4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cysrt1Q9D1E4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cysrt1Q9D1E4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cysrt1Q9D1E4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cysrt1Q9D1E4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cysrt1Q9D1E4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cysrt1Q9D1E4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cysrt1Q9D1E4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cysrt1Q9D1E4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cysrt1Q9D1E4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cysrt1Q9D1E4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cysrt1Q9D1E4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cysrt1Q9D1E4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cysrt1Q9D1E4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cysrt1Q9D1E4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cysrt1Q9D1E4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cysrt1Q9D1E4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cysrt1Q9D1E4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cysrt1Q9D1E4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cysrt1Q9D1E4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cysrt1Q9D1E4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cysrt1Q9D1E4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cysrt1Q9D1E4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cysrt1Q9D1E4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cysrt1Q9D1E4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cysrt1Q9D1E4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cysrt1Q9D1E4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cysrt1Q9D1E4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cysrt1Q9D1E4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cysrt1Q9D1E4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cysrt1Q9D1E4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cysrt1Q9D1E4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cysrt1Q9D1E4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cysrt1Q9D1E4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cysrt1Q9D1E4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cysrt1Q9D1E4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cysrt1Q9D1E4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cysrt1Q9D1E4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cysrt1Q9D1E4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cysrt1Q9D1E4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cysrt1Q9D1E4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cysrt1Q9D1E4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cysrt1Q9D1E4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cysrt1Q9D1E4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cysrt1Q9D1E4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cysrt1Q9D1E4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cysrt1Q9D1E4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cysrt1Q9D1E4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cysrt1Q9D1E4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms