Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Syf2Q9D198 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms