Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0P5

Pygo1, Pygopus homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pygo1Q9D0P5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pygo1Q9D0P5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pygo1Q9D0P5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pygo1Q9D0P5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pygo1Q9D0P5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pygo1Q9D0P5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pygo1Q9D0P5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pygo1Q9D0P5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pygo1Q9D0P5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pygo1Q9D0P5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pygo1Q9D0P5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pygo1Q9D0P5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pygo1Q9D0P5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pygo1Q9D0P5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pygo1Q9D0P5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pygo1Q9D0P5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pygo1Q9D0P5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pygo1Q9D0P5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pygo1Q9D0P5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pygo1Q9D0P5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pygo1Q9D0P5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pygo1Q9D0P5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pygo1Q9D0P5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pygo1Q9D0P5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pygo1Q9D0P5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pygo1Q9D0P5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pygo1Q9D0P5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pygo1Q9D0P5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pygo1Q9D0P5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pygo1Q9D0P5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pygo1Q9D0P5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pygo1Q9D0P5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pygo1Q9D0P5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pygo1Q9D0P5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pygo1Q9D0P5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pygo1Q9D0P5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pygo1Q9D0P5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pygo1Q9D0P5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pygo1Q9D0P5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pygo1Q9D0P5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pygo1Q9D0P5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pygo1Q9D0P5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pygo1Q9D0P5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pygo1Q9D0P5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pygo1Q9D0P5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pygo1Q9D0P5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pygo1Q9D0P5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pygo1Q9D0P5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pygo1Q9D0P5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pygo1Q9D0P5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pygo1Q9D0P5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pygo1Q9D0P5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pygo1Q9D0P5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pygo1Q9D0P5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pygo1Q9D0P5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pygo1Q9D0P5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pygo1Q9D0P5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pygo1Q9D0P5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pygo1Q9D0P5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pygo1Q9D0P5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pygo1Q9D0P5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pygo1Q9D0P5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pygo1Q9D0P5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pygo1Q9D0P5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pygo1Q9D0P5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pygo1Q9D0P5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pygo1Q9D0P5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pygo1Q9D0P5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pygo1Q9D0P5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pygo1Q9D0P5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pygo1Q9D0P5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pygo1Q9D0P5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pygo1Q9D0P5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pygo1Q9D0P5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pygo1Q9D0P5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pygo1Q9D0P5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pygo1Q9D0P5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pygo1Q9D0P5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pygo1Q9D0P5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pygo1Q9D0P5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pygo1Q9D0P5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pygo1Q9D0P5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pygo1Q9D0P5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pygo1Q9D0P5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pygo1Q9D0P5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pygo1Q9D0P5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pygo1Q9D0P5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pygo1Q9D0P5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pygo1Q9D0P5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pygo1Q9D0P5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pygo1Q9D0P5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pygo1Q9D0P5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pygo1Q9D0P5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pygo1Q9D0P5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pygo1Q9D0P5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pygo1Q9D0P5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pygo1Q9D0P5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pygo1Q9D0P5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pygo1Q9D0P5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pygo1Q9D0P5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms