Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmem88Q9D0N8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem88Q9D0N8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms