Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0E3

Lysmd1, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd1Q9D0E3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lysmd1Q9D0E3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lysmd1Q9D0E3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lysmd1Q9D0E3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lysmd1Q9D0E3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lysmd1Q9D0E3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lysmd1Q9D0E3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lysmd1Q9D0E3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lysmd1Q9D0E3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lysmd1Q9D0E3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lysmd1Q9D0E3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lysmd1Q9D0E3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lysmd1Q9D0E3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lysmd1Q9D0E3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lysmd1Q9D0E3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lysmd1Q9D0E3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lysmd1Q9D0E3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lysmd1Q9D0E3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Lysmd1Q9D0E3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lysmd1Q9D0E3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lysmd1Q9D0E3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lysmd1Q9D0E3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lysmd1Q9D0E3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Lysmd1Q9D0E3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lysmd1Q9D0E3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lysmd1Q9D0E3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lysmd1Q9D0E3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lysmd1Q9D0E3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lysmd1Q9D0E3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lysmd1Q9D0E3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Lysmd1Q9D0E3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lysmd1Q9D0E3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lysmd1Q9D0E3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lysmd1Q9D0E3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lysmd1Q9D0E3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lysmd1Q9D0E3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lysmd1Q9D0E3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lysmd1Q9D0E3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lysmd1Q9D0E3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lysmd1Q9D0E3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lysmd1Q9D0E3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lysmd1Q9D0E3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lysmd1Q9D0E3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lysmd1Q9D0E3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lysmd1Q9D0E3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lysmd1Q9D0E3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lysmd1Q9D0E3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lysmd1Q9D0E3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lysmd1Q9D0E3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lysmd1Q9D0E3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Lysmd1Q9D0E3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lysmd1Q9D0E3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lysmd1Q9D0E3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lysmd1Q9D0E3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lysmd1Q9D0E3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lysmd1Q9D0E3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lysmd1Q9D0E3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lysmd1Q9D0E3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lysmd1Q9D0E3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lysmd1Q9D0E3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lysmd1Q9D0E3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lysmd1Q9D0E3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lysmd1Q9D0E3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lysmd1Q9D0E3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lysmd1Q9D0E3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lysmd1Q9D0E3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lysmd1Q9D0E3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lysmd1Q9D0E3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lysmd1Q9D0E3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lysmd1Q9D0E3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lysmd1Q9D0E3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Lysmd1Q9D0E3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lysmd1Q9D0E3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lysmd1Q9D0E3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lysmd1Q9D0E3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lysmd1Q9D0E3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lysmd1Q9D0E3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lysmd1Q9D0E3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lysmd1Q9D0E3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lysmd1Q9D0E3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lysmd1Q9D0E3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lysmd1Q9D0E3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Lysmd1Q9D0E3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lysmd1Q9D0E3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lysmd1Q9D0E3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lysmd1Q9D0E3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lysmd1Q9D0E3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lysmd1Q9D0E3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lysmd1Q9D0E3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lysmd1Q9D0E3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lysmd1Q9D0E3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lysmd1Q9D0E3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lysmd1Q9D0E3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Lysmd1Q9D0E3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lysmd1Q9D0E3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lysmd1Q9D0E3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Lysmd1Q9D0E3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lysmd1Q9D0E3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lysmd1Q9D0E3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lysmd1Q9D0E3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms