Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B8

Ribc1, RIB43A-like with coiled-coils protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc1Q9D0B8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ribc1Q9D0B8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ribc1Q9D0B8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ribc1Q9D0B8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ribc1Q9D0B8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ribc1Q9D0B8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ribc1Q9D0B8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ribc1Q9D0B8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ribc1Q9D0B8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ribc1Q9D0B8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ribc1Q9D0B8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ribc1Q9D0B8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ribc1Q9D0B8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ribc1Q9D0B8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ribc1Q9D0B8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ribc1Q9D0B8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ribc1Q9D0B8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ribc1Q9D0B8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ribc1Q9D0B8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ribc1Q9D0B8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ribc1Q9D0B8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ribc1Q9D0B8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ribc1Q9D0B8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ribc1Q9D0B8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Ribc1Q9D0B8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ribc1Q9D0B8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ribc1Q9D0B8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ribc1Q9D0B8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ribc1Q9D0B8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ribc1Q9D0B8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ribc1Q9D0B8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ribc1Q9D0B8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ribc1Q9D0B8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ribc1Q9D0B8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ribc1Q9D0B8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ribc1Q9D0B8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ribc1Q9D0B8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ribc1Q9D0B8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ribc1Q9D0B8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ribc1Q9D0B8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ribc1Q9D0B8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ribc1Q9D0B8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ribc1Q9D0B8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ribc1Q9D0B8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ribc1Q9D0B8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ribc1Q9D0B8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ribc1Q9D0B8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ribc1Q9D0B8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ribc1Q9D0B8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ribc1Q9D0B8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ribc1Q9D0B8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ribc1Q9D0B8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ribc1Q9D0B8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ribc1Q9D0B8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ribc1Q9D0B8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ribc1Q9D0B8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ribc1Q9D0B8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ribc1Q9D0B8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ribc1Q9D0B8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ribc1Q9D0B8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ribc1Q9D0B8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ribc1Q9D0B8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ribc1Q9D0B8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ribc1Q9D0B8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ribc1Q9D0B8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ribc1Q9D0B8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ribc1Q9D0B8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ribc1Q9D0B8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ribc1Q9D0B8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ribc1Q9D0B8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ribc1Q9D0B8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ribc1Q9D0B8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ribc1Q9D0B8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ribc1Q9D0B8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ribc1Q9D0B8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms