Protein–RNA interactions for Protein: Q9D083

Spc24, Kinetochore protein Spc24, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spc24Q9D083 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Spc24Q9D083 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Spc24Q9D083 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spc24Q9D083 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spc24Q9D083 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spc24Q9D083 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spc24Q9D083 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spc24Q9D083 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spc24Q9D083 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spc24Q9D083 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spc24Q9D083 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spc24Q9D083 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spc24Q9D083 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spc24Q9D083 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spc24Q9D083 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spc24Q9D083 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spc24Q9D083 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spc24Q9D083 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spc24Q9D083 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spc24Q9D083 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spc24Q9D083 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spc24Q9D083 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spc24Q9D083 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spc24Q9D083 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spc24Q9D083 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Spc24Q9D083 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spc24Q9D083 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spc24Q9D083 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spc24Q9D083 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spc24Q9D083 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spc24Q9D083 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spc24Q9D083 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spc24Q9D083 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spc24Q9D083 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spc24Q9D083 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spc24Q9D083 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spc24Q9D083 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spc24Q9D083 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spc24Q9D083 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spc24Q9D083 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spc24Q9D083 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spc24Q9D083 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spc24Q9D083 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Spc24Q9D083 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spc24Q9D083 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Spc24Q9D083 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spc24Q9D083 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spc24Q9D083 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spc24Q9D083 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Spc24Q9D083 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spc24Q9D083 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spc24Q9D083 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spc24Q9D083 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spc24Q9D083 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spc24Q9D083 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Spc24Q9D083 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Spc24Q9D083 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spc24Q9D083 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spc24Q9D083 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spc24Q9D083 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spc24Q9D083 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spc24Q9D083 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spc24Q9D083 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spc24Q9D083 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spc24Q9D083 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spc24Q9D083 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spc24Q9D083 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spc24Q9D083 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spc24Q9D083 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spc24Q9D083 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spc24Q9D083 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spc24Q9D083 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spc24Q9D083 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spc24Q9D083 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spc24Q9D083 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spc24Q9D083 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spc24Q9D083 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spc24Q9D083 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spc24Q9D083 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spc24Q9D083 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spc24Q9D083 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spc24Q9D083 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Spc24Q9D083 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spc24Q9D083 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spc24Q9D083 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spc24Q9D083 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spc24Q9D083 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spc24Q9D083 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spc24Q9D083 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spc24Q9D083 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spc24Q9D083 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spc24Q9D083 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spc24Q9D083 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spc24Q9D083 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spc24Q9D083 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spc24Q9D083 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spc24Q9D083 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spc24Q9D083 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spc24Q9D083 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spc24Q9D083 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms