Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mms19Q9D071 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mms19Q9D071 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mms19Q9D071 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mms19Q9D071 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mms19Q9D071 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mms19Q9D071 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mms19Q9D071 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mms19Q9D071 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Mms19Q9D071 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mms19Q9D071 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mms19Q9D071 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mms19Q9D071 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mms19Q9D071 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mms19Q9D071 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mms19Q9D071 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mms19Q9D071 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mms19Q9D071 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mms19Q9D071 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mms19Q9D071 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mms19Q9D071 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mms19Q9D071 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mms19Q9D071 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mms19Q9D071 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mms19Q9D071 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mms19Q9D071 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Mms19Q9D071 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mms19Q9D071 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mms19Q9D071 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mms19Q9D071 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mms19Q9D071 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mms19Q9D071 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mms19Q9D071 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mms19Q9D071 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mms19Q9D071 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mms19Q9D071 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mms19Q9D071 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Mms19Q9D071 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mms19Q9D071 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mms19Q9D071 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mms19Q9D071 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mms19Q9D071 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mms19Q9D071 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mms19Q9D071 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mms19Q9D071 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mms19Q9D071 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Mms19Q9D071 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mms19Q9D071 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mms19Q9D071 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mms19Q9D071 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Mms19Q9D071 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mms19Q9D071 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mms19Q9D071 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mms19Q9D071 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mms19Q9D071 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mms19Q9D071 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mms19Q9D071 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Mms19Q9D071 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mms19Q9D071 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mms19Q9D071 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mms19Q9D071 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Mms19Q9D071 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mms19Q9D071 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mms19Q9D071 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mms19Q9D071 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mms19Q9D071 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mms19Q9D071 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mms19Q9D071 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mms19Q9D071 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mms19Q9D071 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mms19Q9D071 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mms19Q9D071 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mms19Q9D071 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mms19Q9D071 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mms19Q9D071 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mms19Q9D071 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mms19Q9D071 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mms19Q9D071 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mms19Q9D071 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mms19Q9D071 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mms19Q9D071 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mms19Q9D071 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mms19Q9D071 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mms19Q9D071 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mms19Q9D071 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mms19Q9D071 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mms19Q9D071 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mms19Q9D071 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mms19Q9D071 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mms19Q9D071 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mms19Q9D071 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mms19Q9D071 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mms19Q9D071 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mms19Q9D071 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mms19Q9D071 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mms19Q9D071 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mms19Q9D071 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mms19Q9D071 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mms19Q9D071 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Mms19Q9D071 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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