Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc47Q9D024 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc47Q9D024 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc47Q9D024 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc47Q9D024 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc47Q9D024 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc47Q9D024 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc47Q9D024 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc47Q9D024 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc47Q9D024 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc47Q9D024 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc47Q9D024 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc47Q9D024 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc47Q9D024 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc47Q9D024 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc47Q9D024 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc47Q9D024 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc47Q9D024 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc47Q9D024 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc47Q9D024 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc47Q9D024 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc47Q9D024 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc47Q9D024 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc47Q9D024 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc47Q9D024 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc47Q9D024 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc47Q9D024 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc47Q9D024 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc47Q9D024 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc47Q9D024 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc47Q9D024 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc47Q9D024 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc47Q9D024 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc47Q9D024 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc47Q9D024 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc47Q9D024 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc47Q9D024 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc47Q9D024 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc47Q9D024 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc47Q9D024 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc47Q9D024 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc47Q9D024 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc47Q9D024 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc47Q9D024 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc47Q9D024 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc47Q9D024 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc47Q9D024 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc47Q9D024 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc47Q9D024 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc47Q9D024 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc47Q9D024 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc47Q9D024 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc47Q9D024 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc47Q9D024 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc47Q9D024 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc47Q9D024 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc47Q9D024 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc47Q9D024 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc47Q9D024 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc47Q9D024 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc47Q9D024 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc47Q9D024 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc47Q9D024 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc47Q9D024 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc47Q9D024 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc47Q9D024 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc47Q9D024 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc47Q9D024 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc47Q9D024 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc47Q9D024 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc47Q9D024 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc47Q9D024 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc47Q9D024 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc47Q9D024 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc47Q9D024 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc47Q9D024 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc47Q9D024 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc47Q9D024 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc47Q9D024 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc47Q9D024 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc47Q9D024 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc47Q9D024 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc47Q9D024 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc47Q9D024 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc47Q9D024 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc47Q9D024 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc47Q9D024 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc47Q9D024 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc47Q9D024 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc47Q9D024 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc47Q9D024 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc47Q9D024 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc47Q9D024 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc47Q9D024 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc47Q9D024 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc47Q9D024 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc47Q9D024 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc47Q9D024 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc47Q9D024 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc47Q9D024 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms