Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nde1Q9CZA6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nde1Q9CZA6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nde1Q9CZA6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nde1Q9CZA6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nde1Q9CZA6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nde1Q9CZA6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nde1Q9CZA6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nde1Q9CZA6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Nde1Q9CZA6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nde1Q9CZA6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nde1Q9CZA6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nde1Q9CZA6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nde1Q9CZA6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nde1Q9CZA6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nde1Q9CZA6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nde1Q9CZA6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nde1Q9CZA6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nde1Q9CZA6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nde1Q9CZA6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nde1Q9CZA6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nde1Q9CZA6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nde1Q9CZA6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nde1Q9CZA6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nde1Q9CZA6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nde1Q9CZA6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nde1Q9CZA6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nde1Q9CZA6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nde1Q9CZA6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nde1Q9CZA6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nde1Q9CZA6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nde1Q9CZA6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nde1Q9CZA6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nde1Q9CZA6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nde1Q9CZA6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nde1Q9CZA6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nde1Q9CZA6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nde1Q9CZA6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nde1Q9CZA6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nde1Q9CZA6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nde1Q9CZA6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nde1Q9CZA6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nde1Q9CZA6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nde1Q9CZA6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms