Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ49

Klhl35, Kelch-like protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl35Q9CZ49 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl35Q9CZ49 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl35Q9CZ49 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl35Q9CZ49 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl35Q9CZ49 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl35Q9CZ49 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl35Q9CZ49 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl35Q9CZ49 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl35Q9CZ49 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl35Q9CZ49 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl35Q9CZ49 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl35Q9CZ49 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl35Q9CZ49 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl35Q9CZ49 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl35Q9CZ49 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl35Q9CZ49 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl35Q9CZ49 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl35Q9CZ49 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl35Q9CZ49 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl35Q9CZ49 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl35Q9CZ49 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl35Q9CZ49 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl35Q9CZ49 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl35Q9CZ49 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl35Q9CZ49 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl35Q9CZ49 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl35Q9CZ49 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl35Q9CZ49 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl35Q9CZ49 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl35Q9CZ49 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl35Q9CZ49 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl35Q9CZ49 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl35Q9CZ49 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl35Q9CZ49 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl35Q9CZ49 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl35Q9CZ49 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl35Q9CZ49 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl35Q9CZ49 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl35Q9CZ49 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl35Q9CZ49 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl35Q9CZ49 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms