Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gins3Q9CY94 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gins3Q9CY94 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gins3Q9CY94 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gins3Q9CY94 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gins3Q9CY94 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gins3Q9CY94 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gins3Q9CY94 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gins3Q9CY94 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gins3Q9CY94 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gins3Q9CY94 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gins3Q9CY94 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gins3Q9CY94 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gins3Q9CY94 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gins3Q9CY94 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gins3Q9CY94 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gins3Q9CY94 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gins3Q9CY94 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gins3Q9CY94 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gins3Q9CY94 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gins3Q9CY94 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gins3Q9CY94 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gins3Q9CY94 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gins3Q9CY94 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gins3Q9CY94 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gins3Q9CY94 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gins3Q9CY94 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gins3Q9CY94 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gins3Q9CY94 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gins3Q9CY94 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gins3Q9CY94 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gins3Q9CY94 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms