Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms