Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms