Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmed5Q9CXE7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmed5Q9CXE7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmed5Q9CXE7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmed5Q9CXE7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmed5Q9CXE7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmed5Q9CXE7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmed5Q9CXE7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmed5Q9CXE7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmed5Q9CXE7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmed5Q9CXE7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmed5Q9CXE7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmed5Q9CXE7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmed5Q9CXE7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmed5Q9CXE7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmed5Q9CXE7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmed5Q9CXE7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmed5Q9CXE7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmed5Q9CXE7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmed5Q9CXE7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmed5Q9CXE7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmed5Q9CXE7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmed5Q9CXE7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmed5Q9CXE7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmed5Q9CXE7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmed5Q9CXE7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmed5Q9CXE7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmed5Q9CXE7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmed5Q9CXE7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmed5Q9CXE7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmed5Q9CXE7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tmed5Q9CXE7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tmed5Q9CXE7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tmed5Q9CXE7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tmed5Q9CXE7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tmed5Q9CXE7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tmed5Q9CXE7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tmed5Q9CXE7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tmed5Q9CXE7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmed5Q9CXE7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms