Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Xrcc3Q9CXE6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms