Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWZ3

Rbm8a, RNA-binding protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm8aQ9CWZ3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rbm8aQ9CWZ3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rbm8aQ9CWZ3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rbm8aQ9CWZ3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rbm8aQ9CWZ3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rbm8aQ9CWZ3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rbm8aQ9CWZ3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rbm8aQ9CWZ3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rbm8aQ9CWZ3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rbm8aQ9CWZ3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rbm8aQ9CWZ3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rbm8aQ9CWZ3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rbm8aQ9CWZ3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rbm8aQ9CWZ3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rbm8aQ9CWZ3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rbm8aQ9CWZ3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rbm8aQ9CWZ3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rbm8aQ9CWZ3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rbm8aQ9CWZ3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbm8aQ9CWZ3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbm8aQ9CWZ3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbm8aQ9CWZ3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbm8aQ9CWZ3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbm8aQ9CWZ3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbm8aQ9CWZ3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbm8aQ9CWZ3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbm8aQ9CWZ3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rbm8aQ9CWZ3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rbm8aQ9CWZ3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rbm8aQ9CWZ3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rbm8aQ9CWZ3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rbm8aQ9CWZ3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rbm8aQ9CWZ3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rbm8aQ9CWZ3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rbm8aQ9CWZ3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rbm8aQ9CWZ3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rbm8aQ9CWZ3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rbm8aQ9CWZ3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rbm8aQ9CWZ3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rbm8aQ9CWZ3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rbm8aQ9CWZ3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms