Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RpainQ9CWY9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RpainQ9CWY9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms