Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cxxc1Q9CWW7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cxxc1Q9CWW7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cxxc1Q9CWW7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cxxc1Q9CWW7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cxxc1Q9CWW7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cxxc1Q9CWW7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cxxc1Q9CWW7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cxxc1Q9CWW7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cxxc1Q9CWW7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cxxc1Q9CWW7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cxxc1Q9CWW7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cxxc1Q9CWW7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cxxc1Q9CWW7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cxxc1Q9CWW7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cxxc1Q9CWW7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cxxc1Q9CWW7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cxxc1Q9CWW7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cxxc1Q9CWW7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cxxc1Q9CWW7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cxxc1Q9CWW7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cxxc1Q9CWW7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cxxc1Q9CWW7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cxxc1Q9CWW7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cxxc1Q9CWW7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cxxc1Q9CWW7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cxxc1Q9CWW7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cxxc1Q9CWW7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cxxc1Q9CWW7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cxxc1Q9CWW7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cxxc1Q9CWW7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cxxc1Q9CWW7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cxxc1Q9CWW7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cxxc1Q9CWW7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cxxc1Q9CWW7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cxxc1Q9CWW7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cxxc1Q9CWW7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cxxc1Q9CWW7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cxxc1Q9CWW7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cxxc1Q9CWW7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cxxc1Q9CWW7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cxxc1Q9CWW7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cxxc1Q9CWW7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cxxc1Q9CWW7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cxxc1Q9CWW7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cxxc1Q9CWW7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cxxc1Q9CWW7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cxxc1Q9CWW7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cxxc1Q9CWW7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cxxc1Q9CWW7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cxxc1Q9CWW7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cxxc1Q9CWW7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cxxc1Q9CWW7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cxxc1Q9CWW7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cxxc1Q9CWW7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cxxc1Q9CWW7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cxxc1Q9CWW7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cxxc1Q9CWW7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cxxc1Q9CWW7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cxxc1Q9CWW7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cxxc1Q9CWW7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cxxc1Q9CWW7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cxxc1Q9CWW7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cxxc1Q9CWW7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cxxc1Q9CWW7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cxxc1Q9CWW7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cxxc1Q9CWW7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cxxc1Q9CWW7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cxxc1Q9CWW7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cxxc1Q9CWW7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cxxc1Q9CWW7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cxxc1Q9CWW7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cxxc1Q9CWW7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cxxc1Q9CWW7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cxxc1Q9CWW7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cxxc1Q9CWW7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cxxc1Q9CWW7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms