Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWR2

Smyd3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd3Q9CWR2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smyd3Q9CWR2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smyd3Q9CWR2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smyd3Q9CWR2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smyd3Q9CWR2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
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Smyd3Q9CWR2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smyd3Q9CWR2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smyd3Q9CWR2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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Smyd3Q9CWR2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smyd3Q9CWR2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Smyd3Q9CWR2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smyd3Q9CWR2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Smyd3Q9CWR2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Smyd3Q9CWR2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smyd3Q9CWR2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Smyd3Q9CWR2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Smyd3Q9CWR2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Smyd3Q9CWR2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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Smyd3Q9CWR2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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Smyd3Q9CWR2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Smyd3Q9CWR2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Smyd3Q9CWR2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Smyd3Q9CWR2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smyd3Q9CWR2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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