Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NubplQ9CWD8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms