Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atxn3Q9CVD2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atxn3Q9CVD2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atxn3Q9CVD2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atxn3Q9CVD2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atxn3Q9CVD2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atxn3Q9CVD2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atxn3Q9CVD2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atxn3Q9CVD2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atxn3Q9CVD2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atxn3Q9CVD2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atxn3Q9CVD2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atxn3Q9CVD2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atxn3Q9CVD2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atxn3Q9CVD2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atxn3Q9CVD2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atxn3Q9CVD2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atxn3Q9CVD2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atxn3Q9CVD2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atxn3Q9CVD2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atxn3Q9CVD2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atxn3Q9CVD2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atxn3Q9CVD2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Atxn3Q9CVD2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atxn3Q9CVD2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atxn3Q9CVD2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atxn3Q9CVD2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atxn3Q9CVD2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atxn3Q9CVD2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Atxn3Q9CVD2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atxn3Q9CVD2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atxn3Q9CVD2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atxn3Q9CVD2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atxn3Q9CVD2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Atxn3Q9CVD2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Atxn3Q9CVD2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Atxn3Q9CVD2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Atxn3Q9CVD2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Atxn3Q9CVD2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atxn3Q9CVD2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atxn3Q9CVD2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atxn3Q9CVD2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atxn3Q9CVD2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atxn3Q9CVD2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atxn3Q9CVD2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atxn3Q9CVD2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atxn3Q9CVD2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Atxn3Q9CVD2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Atxn3Q9CVD2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atxn3Q9CVD2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atxn3Q9CVD2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atxn3Q9CVD2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atxn3Q9CVD2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atxn3Q9CVD2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atxn3Q9CVD2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atxn3Q9CVD2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atxn3Q9CVD2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atxn3Q9CVD2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atxn3Q9CVD2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atxn3Q9CVD2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atxn3Q9CVD2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atxn3Q9CVD2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atxn3Q9CVD2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atxn3Q9CVD2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atxn3Q9CVD2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atxn3Q9CVD2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atxn3Q9CVD2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atxn3Q9CVD2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atxn3Q9CVD2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atxn3Q9CVD2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atxn3Q9CVD2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Atxn3Q9CVD2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atxn3Q9CVD2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atxn3Q9CVD2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atxn3Q9CVD2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atxn3Q9CVD2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atxn3Q9CVD2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Atxn3Q9CVD2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atxn3Q9CVD2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atxn3Q9CVD2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atxn3Q9CVD2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atxn3Q9CVD2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atxn3Q9CVD2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atxn3Q9CVD2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atxn3Q9CVD2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atxn3Q9CVD2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atxn3Q9CVD2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atxn3Q9CVD2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atxn3Q9CVD2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atxn3Q9CVD2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atxn3Q9CVD2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atxn3Q9CVD2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atxn3Q9CVD2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atxn3Q9CVD2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atxn3Q9CVD2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atxn3Q9CVD2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atxn3Q9CVD2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Atxn3Q9CVD2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Atxn3Q9CVD2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atxn3Q9CVD2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms