Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sppl3Q9CUS9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sppl3Q9CUS9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sppl3Q9CUS9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sppl3Q9CUS9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sppl3Q9CUS9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sppl3Q9CUS9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sppl3Q9CUS9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sppl3Q9CUS9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sppl3Q9CUS9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sppl3Q9CUS9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sppl3Q9CUS9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sppl3Q9CUS9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sppl3Q9CUS9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sppl3Q9CUS9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sppl3Q9CUS9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sppl3Q9CUS9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sppl3Q9CUS9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sppl3Q9CUS9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sppl3Q9CUS9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sppl3Q9CUS9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sppl3Q9CUS9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sppl3Q9CUS9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sppl3Q9CUS9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sppl3Q9CUS9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sppl3Q9CUS9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sppl3Q9CUS9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sppl3Q9CUS9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sppl3Q9CUS9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sppl3Q9CUS9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sppl3Q9CUS9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sppl3Q9CUS9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sppl3Q9CUS9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sppl3Q9CUS9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sppl3Q9CUS9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sppl3Q9CUS9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sppl3Q9CUS9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sppl3Q9CUS9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sppl3Q9CUS9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sppl3Q9CUS9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sppl3Q9CUS9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sppl3Q9CUS9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Sppl3Q9CUS9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sppl3Q9CUS9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sppl3Q9CUS9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sppl3Q9CUS9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sppl3Q9CUS9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sppl3Q9CUS9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sppl3Q9CUS9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sppl3Q9CUS9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sppl3Q9CUS9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sppl3Q9CUS9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sppl3Q9CUS9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sppl3Q9CUS9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sppl3Q9CUS9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sppl3Q9CUS9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sppl3Q9CUS9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sppl3Q9CUS9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sppl3Q9CUS9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sppl3Q9CUS9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sppl3Q9CUS9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sppl3Q9CUS9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sppl3Q9CUS9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sppl3Q9CUS9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sppl3Q9CUS9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sppl3Q9CUS9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sppl3Q9CUS9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sppl3Q9CUS9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sppl3Q9CUS9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sppl3Q9CUS9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sppl3Q9CUS9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sppl3Q9CUS9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sppl3Q9CUS9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sppl3Q9CUS9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sppl3Q9CUS9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sppl3Q9CUS9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sppl3Q9CUS9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sppl3Q9CUS9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Sppl3Q9CUS9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sppl3Q9CUS9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sppl3Q9CUS9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sppl3Q9CUS9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sppl3Q9CUS9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sppl3Q9CUS9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sppl3Q9CUS9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sppl3Q9CUS9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sppl3Q9CUS9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sppl3Q9CUS9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sppl3Q9CUS9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sppl3Q9CUS9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sppl3Q9CUS9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sppl3Q9CUS9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sppl3Q9CUS9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sppl3Q9CUS9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sppl3Q9CUS9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sppl3Q9CUS9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sppl3Q9CUS9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sppl3Q9CUS9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sppl3Q9CUS9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sppl3Q9CUS9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms