Protein–RNA interactions for Protein: Q9CU62

Smc1a, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1aQ9CU62 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Smc1aQ9CU62 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smc1aQ9CU62 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smc1aQ9CU62 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smc1aQ9CU62 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smc1aQ9CU62 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smc1aQ9CU62 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smc1aQ9CU62 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smc1aQ9CU62 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smc1aQ9CU62 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smc1aQ9CU62 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smc1aQ9CU62 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smc1aQ9CU62 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smc1aQ9CU62 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smc1aQ9CU62 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smc1aQ9CU62 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smc1aQ9CU62 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smc1aQ9CU62 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smc1aQ9CU62 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smc1aQ9CU62 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smc1aQ9CU62 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smc1aQ9CU62 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Smc1aQ9CU62 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smc1aQ9CU62 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smc1aQ9CU62 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smc1aQ9CU62 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smc1aQ9CU62 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smc1aQ9CU62 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smc1aQ9CU62 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smc1aQ9CU62 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Smc1aQ9CU62 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smc1aQ9CU62 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smc1aQ9CU62 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smc1aQ9CU62 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smc1aQ9CU62 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smc1aQ9CU62 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smc1aQ9CU62 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smc1aQ9CU62 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smc1aQ9CU62 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smc1aQ9CU62 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smc1aQ9CU62 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smc1aQ9CU62 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smc1aQ9CU62 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Smc1aQ9CU62 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smc1aQ9CU62 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smc1aQ9CU62 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smc1aQ9CU62 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smc1aQ9CU62 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smc1aQ9CU62 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smc1aQ9CU62 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smc1aQ9CU62 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smc1aQ9CU62 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smc1aQ9CU62 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smc1aQ9CU62 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smc1aQ9CU62 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smc1aQ9CU62 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smc1aQ9CU62 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smc1aQ9CU62 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smc1aQ9CU62 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smc1aQ9CU62 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smc1aQ9CU62 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smc1aQ9CU62 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smc1aQ9CU62 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smc1aQ9CU62 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms