Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snw1Q9CSN1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snw1Q9CSN1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snw1Q9CSN1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snw1Q9CSN1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snw1Q9CSN1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Snw1Q9CSN1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snw1Q9CSN1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snw1Q9CSN1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snw1Q9CSN1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Snw1Q9CSN1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snw1Q9CSN1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Snw1Q9CSN1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snw1Q9CSN1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snw1Q9CSN1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snw1Q9CSN1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snw1Q9CSN1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snw1Q9CSN1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snw1Q9CSN1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snw1Q9CSN1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snw1Q9CSN1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snw1Q9CSN1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snw1Q9CSN1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snw1Q9CSN1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snw1Q9CSN1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snw1Q9CSN1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snw1Q9CSN1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snw1Q9CSN1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snw1Q9CSN1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snw1Q9CSN1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snw1Q9CSN1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snw1Q9CSN1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snw1Q9CSN1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snw1Q9CSN1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snw1Q9CSN1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snw1Q9CSN1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snw1Q9CSN1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snw1Q9CSN1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snw1Q9CSN1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Snw1Q9CSN1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Snw1Q9CSN1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snw1Q9CSN1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snw1Q9CSN1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snw1Q9CSN1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snw1Q9CSN1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snw1Q9CSN1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snw1Q9CSN1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Snw1Q9CSN1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snw1Q9CSN1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snw1Q9CSN1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snw1Q9CSN1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snw1Q9CSN1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snw1Q9CSN1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snw1Q9CSN1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snw1Q9CSN1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Snw1Q9CSN1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snw1Q9CSN1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snw1Q9CSN1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snw1Q9CSN1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snw1Q9CSN1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snw1Q9CSN1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snw1Q9CSN1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snw1Q9CSN1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snw1Q9CSN1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snw1Q9CSN1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snw1Q9CSN1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snw1Q9CSN1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snw1Q9CSN1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Snw1Q9CSN1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snw1Q9CSN1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snw1Q9CSN1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snw1Q9CSN1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snw1Q9CSN1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snw1Q9CSN1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snw1Q9CSN1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snw1Q9CSN1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snw1Q9CSN1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snw1Q9CSN1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snw1Q9CSN1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snw1Q9CSN1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snw1Q9CSN1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snw1Q9CSN1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snw1Q9CSN1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snw1Q9CSN1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snw1Q9CSN1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snw1Q9CSN1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snw1Q9CSN1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snw1Q9CSN1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snw1Q9CSN1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snw1Q9CSN1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snw1Q9CSN1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snw1Q9CSN1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snw1Q9CSN1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snw1Q9CSN1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snw1Q9CSN1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snw1Q9CSN1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snw1Q9CSN1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snw1Q9CSN1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snw1Q9CSN1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snw1Q9CSN1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms