Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA7

Atp5s, ATP synthase subunit s, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5sQ9CRA7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp5sQ9CRA7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp5sQ9CRA7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp5sQ9CRA7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp5sQ9CRA7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp5sQ9CRA7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp5sQ9CRA7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp5sQ9CRA7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp5sQ9CRA7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp5sQ9CRA7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp5sQ9CRA7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp5sQ9CRA7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp5sQ9CRA7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp5sQ9CRA7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp5sQ9CRA7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp5sQ9CRA7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp5sQ9CRA7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp5sQ9CRA7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp5sQ9CRA7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp5sQ9CRA7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp5sQ9CRA7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp5sQ9CRA7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp5sQ9CRA7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp5sQ9CRA7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp5sQ9CRA7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp5sQ9CRA7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp5sQ9CRA7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp5sQ9CRA7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp5sQ9CRA7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp5sQ9CRA7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp5sQ9CRA7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp5sQ9CRA7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp5sQ9CRA7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp5sQ9CRA7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp5sQ9CRA7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp5sQ9CRA7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp5sQ9CRA7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp5sQ9CRA7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp5sQ9CRA7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp5sQ9CRA7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp5sQ9CRA7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp5sQ9CRA7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp5sQ9CRA7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp5sQ9CRA7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp5sQ9CRA7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp5sQ9CRA7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp5sQ9CRA7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp5sQ9CRA7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp5sQ9CRA7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp5sQ9CRA7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp5sQ9CRA7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp5sQ9CRA7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp5sQ9CRA7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp5sQ9CRA7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp5sQ9CRA7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp5sQ9CRA7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp5sQ9CRA7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp5sQ9CRA7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp5sQ9CRA7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp5sQ9CRA7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp5sQ9CRA7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp5sQ9CRA7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp5sQ9CRA7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp5sQ9CRA7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp5sQ9CRA7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp5sQ9CRA7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp5sQ9CRA7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp5sQ9CRA7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp5sQ9CRA7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp5sQ9CRA7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp5sQ9CRA7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp5sQ9CRA7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp5sQ9CRA7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp5sQ9CRA7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp5sQ9CRA7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp5sQ9CRA7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp5sQ9CRA7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp5sQ9CRA7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp5sQ9CRA7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp5sQ9CRA7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp5sQ9CRA7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp5sQ9CRA7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp5sQ9CRA7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp5sQ9CRA7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp5sQ9CRA7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp5sQ9CRA7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp5sQ9CRA7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp5sQ9CRA7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp5sQ9CRA7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp5sQ9CRA7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp5sQ9CRA7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp5sQ9CRA7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp5sQ9CRA7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp5sQ9CRA7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp5sQ9CRA7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp5sQ9CRA7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp5sQ9CRA7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp5sQ9CRA7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp5sQ9CRA7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp5sQ9CRA7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms