Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klhl28Q9CR40 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Klhl28Q9CR40 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms