Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQV6

Map1lc3b, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3B, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map1lc3bQ9CQV6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Map1lc3bQ9CQV6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Map1lc3bQ9CQV6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Map1lc3bQ9CQV6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Map1lc3bQ9CQV6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Map1lc3bQ9CQV6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Map1lc3bQ9CQV6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Map1lc3bQ9CQV6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Map1lc3bQ9CQV6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Map1lc3bQ9CQV6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms