Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim8Q9CQQ0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms