Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Nicn1Q9CQM0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
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Nicn1Q9CQM0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Nicn1Q9CQM0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Nicn1Q9CQM0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nicn1Q9CQM0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
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Nicn1Q9CQM0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Nicn1Q9CQM0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nicn1Q9CQM0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Nicn1Q9CQM0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Nicn1Q9CQM0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nicn1Q9CQM0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nicn1Q9CQM0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Nicn1Q9CQM0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nicn1Q9CQM0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nicn1Q9CQM0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nicn1Q9CQM0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nicn1Q9CQM0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nicn1Q9CQM0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nicn1Q9CQM0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nicn1Q9CQM0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nicn1Q9CQM0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nicn1Q9CQM0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nicn1Q9CQM0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nicn1Q9CQM0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nicn1Q9CQM0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nicn1Q9CQM0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nicn1Q9CQM0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nicn1Q9CQM0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nicn1Q9CQM0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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