Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl35Q9CQL6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl35Q9CQL6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl35Q9CQL6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl35Q9CQL6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl35Q9CQL6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl35Q9CQL6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl35Q9CQL6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl35Q9CQL6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl35Q9CQL6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl35Q9CQL6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl35Q9CQL6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl35Q9CQL6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl35Q9CQL6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl35Q9CQL6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl35Q9CQL6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl35Q9CQL6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl35Q9CQL6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl35Q9CQL6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl35Q9CQL6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl35Q9CQL6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl35Q9CQL6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl35Q9CQL6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl35Q9CQL6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl35Q9CQL6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl35Q9CQL6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl35Q9CQL6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl35Q9CQL6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl35Q9CQL6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl35Q9CQL6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl35Q9CQL6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl35Q9CQL6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl35Q9CQL6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl35Q9CQL6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Mrpl35Q9CQL6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Mrpl35Q9CQL6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Mrpl35Q9CQL6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Mrpl35Q9CQL6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl35Q9CQL6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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