Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ndufb9Q9CQJ8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndufb9Q9CQJ8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndufb9Q9CQJ8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndufb9Q9CQJ8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ndufb9Q9CQJ8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ndufb9Q9CQJ8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ndufb9Q9CQJ8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ndufb9Q9CQJ8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ndufb9Q9CQJ8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ndufb9Q9CQJ8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ndufb9Q9CQJ8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ndufb9Q9CQJ8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndufb9Q9CQJ8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndufb9Q9CQJ8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndufb9Q9CQJ8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndufb9Q9CQJ8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndufb9Q9CQJ8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndufb9Q9CQJ8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndufb9Q9CQJ8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndufb9Q9CQJ8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndufb9Q9CQJ8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndufb9Q9CQJ8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndufb9Q9CQJ8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndufb9Q9CQJ8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndufb9Q9CQJ8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndufb9Q9CQJ8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndufb9Q9CQJ8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndufb9Q9CQJ8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndufb9Q9CQJ8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndufb9Q9CQJ8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndufb9Q9CQJ8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndufb9Q9CQJ8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndufb9Q9CQJ8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndufb9Q9CQJ8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndufb9Q9CQJ8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndufb9Q9CQJ8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ndufb9Q9CQJ8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ndufb9Q9CQJ8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ndufb9Q9CQJ8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ndufb9Q9CQJ8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ndufb9Q9CQJ8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ndufb9Q9CQJ8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Ndufb9Q9CQJ8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Ndufb9Q9CQJ8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ndufb9Q9CQJ8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ndufb9Q9CQJ8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ndufb9Q9CQJ8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ndufb9Q9CQJ8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ndufb9Q9CQJ8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ndufb9Q9CQJ8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ndufb9Q9CQJ8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ndufb9Q9CQJ8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ndufb9Q9CQJ8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ndufb9Q9CQJ8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ndufb9Q9CQJ8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ndufb9Q9CQJ8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ndufb9Q9CQJ8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndufb9Q9CQJ8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndufb9Q9CQJ8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndufb9Q9CQJ8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndufb9Q9CQJ8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndufb9Q9CQJ8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndufb9Q9CQJ8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndufb9Q9CQJ8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndufb9Q9CQJ8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndufb9Q9CQJ8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndufb9Q9CQJ8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndufb9Q9CQJ8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndufb9Q9CQJ8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndufb9Q9CQJ8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndufb9Q9CQJ8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndufb9Q9CQJ8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndufb9Q9CQJ8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndufb9Q9CQJ8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndufb9Q9CQJ8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndufb9Q9CQJ8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndufb9Q9CQJ8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndufb9Q9CQJ8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndufb9Q9CQJ8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndufb9Q9CQJ8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndufb9Q9CQJ8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndufb9Q9CQJ8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndufb9Q9CQJ8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndufb9Q9CQJ8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndufb9Q9CQJ8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndufb9Q9CQJ8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndufb9Q9CQJ8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ndufb9Q9CQJ8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms