Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed6Q9CQG0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms