Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mrpl11Q9CQF0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mrpl11Q9CQF0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mrpl11Q9CQF0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mrpl11Q9CQF0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mrpl11Q9CQF0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Mrpl11Q9CQF0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Mrpl11Q9CQF0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mrpl11Q9CQF0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mrpl11Q9CQF0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Mrpl11Q9CQF0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mrpl11Q9CQF0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mrpl11Q9CQF0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mrpl11Q9CQF0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mrpl11Q9CQF0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mrpl11Q9CQF0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mrpl11Q9CQF0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mrpl11Q9CQF0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mrpl11Q9CQF0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mrpl11Q9CQF0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mrpl11Q9CQF0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mrpl11Q9CQF0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mrpl11Q9CQF0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Mrpl11Q9CQF0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mrpl11Q9CQF0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mrpl11Q9CQF0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Mrpl11Q9CQF0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mrpl11Q9CQF0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mrpl11Q9CQF0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mrpl11Q9CQF0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mrpl11Q9CQF0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mrpl11Q9CQF0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mrpl11Q9CQF0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mrpl11Q9CQF0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mrpl11Q9CQF0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mrpl11Q9CQF0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mrpl11Q9CQF0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mrpl11Q9CQF0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mrpl11Q9CQF0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mrpl11Q9CQF0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Mrpl11Q9CQF0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mrpl11Q9CQF0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mrpl11Q9CQF0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mrpl11Q9CQF0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mrpl11Q9CQF0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mrpl11Q9CQF0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mrpl11Q9CQF0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mrpl11Q9CQF0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mrpl11Q9CQF0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mrpl11Q9CQF0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mrpl11Q9CQF0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mrpl11Q9CQF0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mrpl11Q9CQF0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mrpl11Q9CQF0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mrpl11Q9CQF0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mrpl11Q9CQF0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mrpl11Q9CQF0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mrpl11Q9CQF0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mrpl11Q9CQF0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mrpl11Q9CQF0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mrpl11Q9CQF0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mrpl11Q9CQF0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mrpl11Q9CQF0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mrpl11Q9CQF0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mrpl11Q9CQF0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mrpl11Q9CQF0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mrpl11Q9CQF0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mrpl11Q9CQF0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mrpl11Q9CQF0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mrpl11Q9CQF0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mrpl11Q9CQF0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mrpl11Q9CQF0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mrpl11Q9CQF0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mrpl11Q9CQF0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mrpl11Q9CQF0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mrpl11Q9CQF0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mrpl11Q9CQF0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mrpl11Q9CQF0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mrpl11Q9CQF0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mrpl11Q9CQF0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mrpl11Q9CQF0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mrpl11Q9CQF0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mrpl11Q9CQF0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mrpl11Q9CQF0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mrpl11Q9CQF0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mrpl11Q9CQF0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mrpl11Q9CQF0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mrpl11Q9CQF0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mrpl11Q9CQF0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mrpl11Q9CQF0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mrpl11Q9CQF0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mrpl11Q9CQF0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mrpl11Q9CQF0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mrpl11Q9CQF0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Mrpl11Q9CQF0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mrpl11Q9CQF0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mrpl11Q9CQF0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mrpl11Q9CQF0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mrpl11Q9CQF0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mrpl11Q9CQF0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms