Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab5aQ9CQD1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms