Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC0

Tpbpb, Trophoblast-specific protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpbpbQ9CQC0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TpbpbQ9CQC0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TpbpbQ9CQC0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TpbpbQ9CQC0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TpbpbQ9CQC0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TpbpbQ9CQC0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TpbpbQ9CQC0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TpbpbQ9CQC0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TpbpbQ9CQC0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TpbpbQ9CQC0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TpbpbQ9CQC0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TpbpbQ9CQC0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TpbpbQ9CQC0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TpbpbQ9CQC0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TpbpbQ9CQC0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TpbpbQ9CQC0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TpbpbQ9CQC0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TpbpbQ9CQC0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TpbpbQ9CQC0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TpbpbQ9CQC0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TpbpbQ9CQC0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TpbpbQ9CQC0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TpbpbQ9CQC0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TpbpbQ9CQC0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TpbpbQ9CQC0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TpbpbQ9CQC0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TpbpbQ9CQC0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TpbpbQ9CQC0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TpbpbQ9CQC0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TpbpbQ9CQC0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TpbpbQ9CQC0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TpbpbQ9CQC0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms