Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Commd4Q9CQ02 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms