Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpl17Q9CPR4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpl17Q9CPR4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpl17Q9CPR4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpl17Q9CPR4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpl17Q9CPR4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpl17Q9CPR4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpl17Q9CPR4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpl17Q9CPR4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpl17Q9CPR4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpl17Q9CPR4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpl17Q9CPR4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpl17Q9CPR4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpl17Q9CPR4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpl17Q9CPR4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpl17Q9CPR4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpl17Q9CPR4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpl17Q9CPR4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpl17Q9CPR4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpl17Q9CPR4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpl17Q9CPR4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rpl17Q9CPR4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rpl17Q9CPR4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rpl17Q9CPR4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpl17Q9CPR4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rpl17Q9CPR4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rpl17Q9CPR4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpl17Q9CPR4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpl17Q9CPR4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpl17Q9CPR4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpl17Q9CPR4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpl17Q9CPR4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpl17Q9CPR4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpl17Q9CPR4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpl17Q9CPR4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpl17Q9CPR4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms