Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim12aQ99PQ1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trim12aQ99PQ1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trim12aQ99PQ1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trim12aQ99PQ1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim12aQ99PQ1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim12aQ99PQ1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim12aQ99PQ1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim12aQ99PQ1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim12aQ99PQ1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim12aQ99PQ1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim12aQ99PQ1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim12aQ99PQ1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim12aQ99PQ1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim12aQ99PQ1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim12aQ99PQ1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim12aQ99PQ1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim12aQ99PQ1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim12aQ99PQ1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim12aQ99PQ1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim12aQ99PQ1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim12aQ99PQ1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim12aQ99PQ1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim12aQ99PQ1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim12aQ99PQ1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim12aQ99PQ1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim12aQ99PQ1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim12aQ99PQ1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
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Trim12aQ99PQ1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim12aQ99PQ1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim12aQ99PQ1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim12aQ99PQ1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim12aQ99PQ1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim12aQ99PQ1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim12aQ99PQ1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim12aQ99PQ1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim12aQ99PQ1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim12aQ99PQ1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim12aQ99PQ1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim12aQ99PQ1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim12aQ99PQ1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim12aQ99PQ1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim12aQ99PQ1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim12aQ99PQ1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim12aQ99PQ1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim12aQ99PQ1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim12aQ99PQ1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim12aQ99PQ1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trim12aQ99PQ1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim12aQ99PQ1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim12aQ99PQ1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim12aQ99PQ1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim12aQ99PQ1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim12aQ99PQ1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim12aQ99PQ1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim12aQ99PQ1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim12aQ99PQ1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim12aQ99PQ1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim12aQ99PQ1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim12aQ99PQ1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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