Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim26Q99PN3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim26Q99PN3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trim26Q99PN3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trim26Q99PN3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trim26Q99PN3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trim26Q99PN3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trim26Q99PN3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trim26Q99PN3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim26Q99PN3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim26Q99PN3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim26Q99PN3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim26Q99PN3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim26Q99PN3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim26Q99PN3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim26Q99PN3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim26Q99PN3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim26Q99PN3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim26Q99PN3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim26Q99PN3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim26Q99PN3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim26Q99PN3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim26Q99PN3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim26Q99PN3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim26Q99PN3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim26Q99PN3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trim26Q99PN3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trim26Q99PN3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trim26Q99PN3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trim26Q99PN3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim26Q99PN3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim26Q99PN3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim26Q99PN3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim26Q99PN3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim26Q99PN3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim26Q99PN3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim26Q99PN3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim26Q99PN3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim26Q99PN3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim26Q99PN3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim26Q99PN3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim26Q99PN3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim26Q99PN3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim26Q99PN3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim26Q99PN3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim26Q99PN3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim26Q99PN3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim26Q99PN3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim26Q99PN3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim26Q99PN3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim26Q99PN3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim26Q99PN3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim26Q99PN3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim26Q99PN3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim26Q99PN3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim26Q99PN3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim26Q99PN3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim26Q99PN3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim26Q99PN3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim26Q99PN3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim26Q99PN3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim26Q99PN3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim26Q99PN3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim26Q99PN3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim26Q99PN3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim26Q99PN3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim26Q99PN3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim26Q99PN3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim26Q99PN3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim26Q99PN3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim26Q99PN3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim26Q99PN3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim26Q99PN3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim26Q99PN3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim26Q99PN3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim26Q99PN3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim26Q99PN3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim26Q99PN3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim26Q99PN3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim26Q99PN3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim26Q99PN3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim26Q99PN3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim26Q99PN3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim26Q99PN3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim26Q99PN3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim26Q99PN3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim26Q99PN3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim26Q99PN3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim26Q99PN3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim26Q99PN3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim26Q99PN3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim26Q99PN3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim26Q99PN3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim26Q99PN3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim26Q99PN3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim26Q99PN3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim26Q99PN3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim26Q99PN3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim26Q99PN3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim26Q99PN3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms